如果说新冠疫情带火了哪项生物技术,核酸检测论第一,病原微生物高通量测序(mNGS)可能应该论第二。
时间回到年12月末,博奥生物、华大基因、微远基因等独立医学检验所相继收到来自武汉市的患者样本。这些患者多因发烧被收治入院,经各种抗生素治疗无效,病情加重,进入ICU,一时无法找到有效的治疗方案,医生希望他们尝试用mNGS技术确定病例样本中的病原体。
据后来发表于《中华医学杂志(英文版)》一篇论文记载,中国医学科学院病原所、医院、湖北省疾控中心、医院、医院、微远基因共同研究团队,收集医院5例重症肺炎患者的临床资料和支气管肺泡灌洗样本,进行mNGS检测,发现从未报告过的、与SARS病*核苷酸序列相似度达79%的冠状病*。
这项发现为破译新冠病*基因组、核酸检测试剂盒研发、新冠病*疫苗开发打下了关键基础。mNGS是指对感染标本直接进行高通量测序,通过微生物专用数据库比对和智能化算法分析,获得疑似致病微生物的种属信息,并提供全面深入的报告分析解读,为疑难危重感染提供快速精准诊断依据。
国内最早对外提供mNGS服务的华大基因,在年上半年财报中表示,其自出开发的PMseq病原微生物高通量基因检测产品已经累计完成约10万例样本检测,主要的样本类型包括血浆、脑脊液、呼吸道样本三大类。有资深从业者向动脉网推算,到年末,全国各个mNGS开发团队累计收到样本数量将超过20万。
mNGS作为高通量基因测序一个新的应用方向,在年前后开始从科研服务逐渐进入临床应用,并在第一时间获得投资机构